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2017年9月13日 18:17

#科學早知道#【新工具幫助科學家繪製染色體複雜構象】美國麻省理工學院研究生Erez Aiden與同事共同開發了一種能在基因組水平上揭示染色體摺疊方式的新工具。這種名為Hi-C的技術不僅能詳細描述影響基因表達的DNA環和結構域,甚至還能將複雜的基因組拼接在一起。

Aiden開發的這種工具名為Juicebox—— 一個基於Java的桌面應用程序。它可以提供Google Maps樣式的染色質交互數據集,允許研究人員從基因組水平放大或縮小觀察其結構特徵。Juicebox的hic文件能以多種解析度存儲每個可能的染色體對的圖塊集。軟體的查詢表可以直接檢索數據,從而加快訪問速度。因此,Juicebox用戶可以無縫探索整個基因組的交互作用,然後放大以查看精細的功能。http://t.cn/Rp0a4Mm