【動物全物種基因組測序仍有很大空白】近日,美國華盛頓州立大學領導的一項研究發現,目前對動物基因組進行的測序多數集中在與人類相似的動物上,研究人員警告稱,該現狀可能會忽視大量的生物多樣性和機會。相關研究結果發表於美國《國家科學院院刊》。

研究人員分析發現,近3300種動物的基因組已被測序。雖然動物物種測序工作一直在進行,但與世界上166萬種動物物種相比,這個數字還是很小的,而脊椎動物在目前的序列中占了絕大部分。數據顯示,盡管脊椎動物只代表了3.9%的動物物種,但卻占測序數據集的54%。相比之下,代表78.5%物種的節肢動物門無脊椎動物(包括昆蟲和蜘蛛),只占當前數據集的34%。

“隨著基因組數據集的迅速積累,我們會思考我們的努力在哪里,目前數據集並不是均勻分布在動物生命樹中。”研究作者、華盛頓州立大學博士後研究員Scott Hotaling認為,無脊椎動物仍然非常缺乏代表性,因為人們似乎更關心脊椎動物,即所謂的“魅力巨型動物”。

類人猿和人類擁有最接近的基因組數據,但人類基因組並不是最大的,在目前所測的動物基因組中,澳大利亞肺魚擁有最大的基因組。

“我們對自己感興趣,這未必是件壞事。”研究通訊作者、楊百翰大學助理教授Paul Frandsen表示,要開始了解整個生態系統,必須開始對更多的生物進行采樣,以獲得更清晰的了解。脊椎動物是生態系統的重要組成部分,但昆蟲和許多其他小型生物可能發揮著更重要的作用,因為它們處於食物鏈的底斷。

研究作者、華盛頓州立大學副教授Joanna Kelley還指出,目前絕大多數基因測序工作發生在發達國家,且大多數國家位於北半球,不同地區的測序工作也有特定的傾向。例如,北美國家對哺乳動物和昆蟲進行了最多的測序,歐洲國家對魚類進行了較多測序,而亞洲則對鳥類進行了較多測序。

近年來,各國家機構宣布了幾項大型的基因組測序工作,其中包括地球生物基因組計劃。該計劃設定了一個雄心勃勃的目標,在未來10年內對所有真核生物(包括動物、細菌和單細胞生物)進行測序。

截至2021年6月,已收集到3300多個動物基因組數據集。研究人員通過計算發現,以目前每天大約測序4個基因組的速度,要到3130年才能達到對所有真核生物進行測序的目標。

研究人員同時提出,促進達成該目標的一個方法是發展基礎設施,並讓更多來自南半球國家的研究人員參與其中,尤其是熱帶地區,因為熱帶地區的動物多樣性豐富。http://t.cn/A6xW126n

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