【栽培靈芝紫芝S2首次完成全基因組測序及分析】近日,福建省農業科學院食用菌研究所創新團隊在《生物技術通報》在線發表研究論文。他們首次完成靈芝栽培品種‘武芝 2 號’(通稱‘紫芝S2’)De novo 測序、組裝。相關論文訊息:http://t.cn/A6xNiHLd

據悉,‘武芝 2 號’是目前國內唯一實現商品化栽培的紫芝品種,於2005年從福建省野生紫芝種質資源中選育得到,2012年通過福建省非主要作物品種認定。近年來,在福建、廣東及廣西等地推廣應用形成年產量達3000噸以上的規模化栽培。

該團隊采用 PacBio SMART 技術並基於三代和二代數據,測序獲得序列總長度 56.849 Mb 的全基因組,包括72條 Scaffolds,其中71條Scaffolds構成核基因組,另外1條為完整的線粒體基因組。

其中,核基因組16681個基因,完成13161個基因的注釋,約占總數的 78.89%,預測分析到4組串聯重複的rRNA基因簇、405個非編碼RNA和3305個啟動子,並找到 rpb2、beta-tubulin、terf-1α、CaM和Mn-SOD等基因序列以及漆酶同工酶基因,鯊烯合酶、羊毛甾醇合酶基因與麥角甾醇合成代謝相關基因、交配型基因座mat A&B及其分布位置,並發現一種新的真菌免疫調節蛋白fip編碼基因。

這為今後紫芝栽培品種(系)分子鑒定與菌株鑒別、功能基因的挖掘與利用提供可靠訊息,同時也為其後續開展中國栽培靈芝種類的比較基因組學分析積累科學數據。

該基因組計劃始於2018年,依托特色食用菌繁育與栽培國家地方(福建省農業科學院)聯合工程研究中心、福建省農業科學院藥用植物研究中心、福建農林大學和中國醫學科學院藥用植物研究所的科研平台完成。http://t.cn/A6xNiHLe

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